MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017782	AAG	2	6	7	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
2	NC_017782	GAT	2	6	25	30	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858668
3	NC_017782	TC	3	6	36	41	0 %	50 %	0 %	50 %	386858668
4	NC_017782	ACA	2	6	58	63	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858668
5	NC_017782	AAATAA	2	12	68	79	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386858668
6	NC_017782	A	6	6	78	83	100 %	0 %	0 %	0 %	386858668
7	NC_017782	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
8	NC_017782	AGA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
9	NC_017782	AGA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
10	NC_017782	AGA	2	6	180	185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
11	NC_017782	AAG	2	6	206	211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
12	NC_017782	GA	3	6	256	261	50 %	0 %	50 %	0 %	386858668
13	NC_017782	TAT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858668
14	NC_017782	AG	3	6	288	293	50 %	0 %	50 %	0 %	386858668
15	NC_017782	ATA	2	6	319	324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858668
16	NC_017782	AAG	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
17	NC_017782	GAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
18	NC_017782	A	6	6	462	467	100 %	0 %	0 %	0 %	386858668
19	NC_017782	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858668
20	NC_017782	TAT	2	6	520	525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858668
21	NC_017782	TAG	2	6	542	547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858668
22	NC_017782	GA	3	6	552	557	50 %	0 %	50 %	0 %	386858668
23	NC_017782	A	6	6	581	586	100 %	0 %	0 %	0 %	386858668
24	NC_017782	TTG	2	6	587	592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858668
25	NC_017782	GT	3	6	614	619	0 %	50 %	50 %	0 %	386858669
26	NC_017782	A	9	9	635	643	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
27	NC_017782	ATA	2	6	695	700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
28	NC_017782	AT	3	6	709	714	50 %	50 %	0 %	0 %	386858669
29	NC_017782	TAA	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
30	NC_017782	T	6	6	775	780	0 %	100 %	0 %	0 %	386858669
31	NC_017782	A	7	7	808	814	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
32	NC_017782	AGA	2	6	843	848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858669
33	NC_017782	T	6	6	866	871	0 %	100 %	0 %	0 %	386858669
34	NC_017782	A	6	6	893	898	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
35	NC_017782	TAT	2	6	955	960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858669
36	NC_017782	AATTTA	2	12	965	976	50 %	50 %	0 %	0 %	386858669
37	NC_017782	A	6	6	976	981	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
38	NC_017782	GT	3	6	986	991	0 %	50 %	50 %	0 %	386858669
39	NC_017782	A	6	6	1024	1029	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
40	NC_017782	A	7	7	1031	1037	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
41	NC_017782	TAA	3	9	1070	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
42	NC_017782	A	6	6	1087	1092	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
43	NC_017782	GAAA	2	8	1109	1116	75 %	0 %	25 %	0 %	386858669
44	NC_017782	TTA	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858669
45	NC_017782	AGG	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858669
46	NC_017782	A	7	7	1151	1157	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
47	NC_017782	AAT	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
48	NC_017782	AGG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858670
49	NC_017782	TTG	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
50	NC_017782	TCT	2	6	1281	1286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858670
51	NC_017782	TTATT	2	10	1292	1301	20 %	80 %	0 %	0 %	386858670
52	NC_017782	TGT	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
53	NC_017782	AT	4	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
54	NC_017782	TAA	2	6	1354	1359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
55	NC_017782	A	6	6	1358	1363	100 %	0 %	0 %	0 %	386858670
56	NC_017782	TAATAT	2	12	1364	1375	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
57	NC_017782	CAGG	2	8	1397	1404	25 %	0 %	50 %	25 %	386858670
58	NC_017782	TTTA	2	8	1460	1467	25 %	75 %	0 %	0 %	386858670
59	NC_017782	ATT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858670
60	NC_017782	ATTAT	2	10	1516	1525	40 %	60 %	0 %	0 %	386858670
61	NC_017782	GTT	2	6	1572	1577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
62	NC_017782	AGT	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858670
63	NC_017782	ATT	2	6	1634	1639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858670
64	NC_017782	TA	3	6	1676	1681	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
65	NC_017782	TTG	2	6	1725	1730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
66	NC_017782	T	6	6	1754	1759	0 %	100 %	0 %	0 %	386858670
67	NC_017782	TAGC	2	8	1798	1805	25 %	25 %	25 %	25 %	386858670
68	NC_017782	TAA	2	6	1823	1828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
69	NC_017782	TA	3	6	1833	1838	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
70	NC_017782	AT	3	6	1852	1857	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
71	NC_017782	TAA	2	6	1859	1864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
72	NC_017782	AG	3	6	1871	1876	50 %	0 %	50 %	0 %	386858670
73	NC_017782	AT	3	6	1988	1993	50 %	50 %	0 %	0 %	386858671
74	NC_017782	A	6	6	2030	2035	100 %	0 %	0 %	0 %	386858671
75	NC_017782	TTA	2	6	2092	2097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858671
76	NC_017782	GATG	2	8	2101	2108	25 %	25 %	50 %	0 %	386858671
77	NC_017782	AT	3	6	2162	2167	50 %	50 %	0 %	0 %	386858671
78	NC_017782	ATT	2	6	2169	2174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858671
79	NC_017782	TTG	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858671
80	NC_017782	GAA	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858671
81	NC_017782	A	6	6	2444	2449	100 %	0 %	0 %	0 %	386858671
82	NC_017782	TAAT	2	8	2459	2466	50 %	50 %	0 %	0 %	386858671
83	NC_017782	AGA	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858672
84	NC_017782	A	6	6	2535	2540	100 %	0 %	0 %	0 %	386858672
85	NC_017782	ATTTT	2	10	2563	2572	20 %	80 %	0 %	0 %	386858672
86	NC_017782	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858672
87	NC_017782	TAT	2	6	2595	2600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858672
88	NC_017782	TAT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858672
89	NC_017782	ATA	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
90	NC_017782	ACA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
91	NC_017782	TAA	3	9	2989	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
92	NC_017782	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
93	NC_017782	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	386858673
94	NC_017782	TAAA	2	8	3072	3079	75 %	25 %	0 %	0 %	386858673
95	NC_017782	TTA	2	6	3144	3149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858673
96	NC_017782	TGT	2	6	3220	3225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858673
97	NC_017782	ACA	3	9	3227	3235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
98	NC_017782	CATT	2	8	3263	3270	25 %	50 %	0 %	25 %	386858673
99	NC_017782	AGA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858673
100	NC_017782	ATA	2	6	3468	3473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
101	NC_017782	CAAT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	0 %	25 %	386858673
102	NC_017782	ATGA	2	8	4671	4678	50 %	25 %	25 %	0 %	386858674
103	NC_017782	AGA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858674
104	NC_017782	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858674
105	NC_017782	CAAT	2	8	4827	4834	50 %	25 %	0 %	25 %	386858674
106	NC_017782	TA	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	386858674
107	NC_017782	TTCT	2	8	4931	4938	0 %	75 %	0 %	25 %	386858674
108	NC_017782	AAAT	2	8	4966	4973	75 %	25 %	0 %	0 %	386858674
109	NC_017782	T	8	8	4992	4999	0 %	100 %	0 %	0 %	386858674
110	NC_017782	TTCTT	2	10	5014	5023	0 %	80 %	0 %	20 %	386858674
111	NC_017782	AAT	2	6	7085	7090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858675
112	NC_017782	TA	3	6	7123	7128	50 %	50 %	0 %	0 %	386858675
113	NC_017782	T	6	6	7140	7145	0 %	100 %	0 %	0 %	386858675
114	NC_017782	TA	3	6	7152	7157	50 %	50 %	0 %	0 %	386858675
115	NC_017782	AAT	2	6	7158	7163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858675
116	NC_017782	AGA	2	6	7169	7174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858675
117	NC_017782	TCATTA	2	12	7289	7300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858675
118	NC_017782	TTA	3	9	7298	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858675
119	NC_017782	AAGG	2	8	7307	7314	50 %	0 %	50 %	0 %	386858675
120	NC_017782	AAT	2	6	7357	7362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858676
121	NC_017782	AGA	2	6	7455	7460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
122	NC_017782	TAA	2	6	7480	7485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858676
123	NC_017782	AAG	2	6	7493	7498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
124	NC_017782	A	7	7	7534	7540	100 %	0 %	0 %	0 %	386858676
125	NC_017782	AGGT	2	8	7545	7552	25 %	25 %	50 %	0 %	386858676
126	NC_017782	A	6	6	7573	7578	100 %	0 %	0 %	0 %	386858676
127	NC_017782	AATT	2	8	7594	7601	50 %	50 %	0 %	0 %	386858676
128	NC_017782	TAAG	2	8	7647	7654	50 %	25 %	25 %	0 %	386858676
129	NC_017782	TAG	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858676
130	NC_017782	GCA	2	6	7682	7687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
131	NC_017782	TGC	2	6	7693	7698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858676
132	NC_017782	CAG	3	9	7707	7715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
133	NC_017782	ATG	3	9	7716	7724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858676
134	NC_017782	AAAG	2	8	7729	7736	75 %	0 %	25 %	0 %	386858676
135	NC_017782	GAAA	2	8	7750	7757	75 %	0 %	25 %	0 %	386858676
136	NC_017782	ATA	2	6	7833	7838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858676
137	NC_017782	GCA	3	9	7874	7882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
138	NC_017782	AGC	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
139	NC_017782	GTG	2	6	7923	7928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858676
140	NC_017782	AAG	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
141	NC_017782	GCT	2	6	7982	7987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858676
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144	NC_017782	AGC	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
145	NC_017782	AGG	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858676
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149	NC_017782	GTA	3	9	8204	8212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858676
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162	NC_017782	TGA	2	6	10073	10078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858677
163	NC_017782	AGA	2	6	10133	10138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858677
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181	NC_017782	TAA	4	12	10776	10787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858677
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191	NC_017782	TAAA	2	8	11118	11125	75 %	25 %	0 %	0 %	386858677

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.